I 1945 lige inden afslutningen på Anden Verdenskrig må Anna og hendes 11-årige søn Felix flygte ud på landet, da deres hjem i München bombes. De rejser til Annas barndomsby, hvor nazismen gennemstrømmer alt. Det står tidligt klart, at familien, der føler sig hjemme blandt liberale musikere, ikke passer ind. Anna kæmper med at optræde som den overbeviste nationalsocialist, hvorimod Felix efterhånden forføres af den nazistiske propaganda og dens tilhængere. Som en dreng fra byen ønsker han for enhver pris at passe ind, koste hvad det vil! Desuden har deres nye hus det perfekte legerum: et magisk, funklende og hemmeligt ”glasværelse” på loftet.

En dag opdager Felix sammen med sine venner en desertør, og de bliver enige om at rapportere ham. Hvad Felix dog ikke ved er, at desertøren er hans egen formodet afdøde far…

GLASVÆRELSET giver et sjældent skildret indblik i krigens dagligdag og er en både rørende, poetisk og livfuld film om, at familie betyder mere end enhver ideologi.